Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Vrk3Q8K3G5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Vrk3Q8K3G5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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