Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms