Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hpf1Q8CFE2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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