Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms