Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ssc5dQ8BV57 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ssc5dQ8BV57 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ssc5dQ8BV57 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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