Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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