Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrc2aQ7TSC1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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