Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shq1Q7TMX5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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