Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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