Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Krt40Q6IFX3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Krt40Q6IFX3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt40Q6IFX3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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