Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms