Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tns3Q5SSZ5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Tns3Q5SSZ5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tns3Q5SSZ5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms