Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Znf354cQ571J5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf354cQ571J5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Znf354cQ571J5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf354cQ571J5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms