Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

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Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms