Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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