Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms