Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MestQ07646 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MestQ07646 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MestQ07646 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MestQ07646 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MestQ07646 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MestQ07646 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms