Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms