Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GscQ02591 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GscQ02591 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms