Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms