Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TnikP83510 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TnikP83510 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TnikP83510 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnikP83510 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnikP83510 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnikP83510 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms