Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Irx1P81068 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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