Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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