Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Cldn18P56857 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Cldn18P56857 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Cldn18P56857 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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