Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GferP56213 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GferP56213 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
GferP56213 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GferP56213 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
GferP56213 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GferP56213 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GferP56213 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
GferP56213 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GferP56213 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
GferP56213 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms