Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VhlP40338 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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