Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Hoxa10P31310 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms