Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms