Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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TP20293 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TP20293 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TP20293 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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