Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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