Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms