Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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