Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5225J3QPL3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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