Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20828J3KMI7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Gm20828J3KMI7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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