Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms