Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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