Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf148G3X9R7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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