Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms