Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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