Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms