Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms