Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms