Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms