Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms