Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms