Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms