Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms