Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ybx3Q9JKB3 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms