Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn2Q9ER65 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms