Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1dQ9DC28 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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